- DADiSP
- 信号処理
【課題】
「DNA」と「DNAがどのような機能を持つか」の関心が高まっています。例としてMichael Crichtonのフィクション作品であるジュラシックパークのような有名な作品にもDNAの話題は出てきます。その作品内では恐竜のDNAから新しい恐竜を生み出しました。人間のDNAの配列を用いたことによって、ヒューマンゲノム計画はDNAに対する理解をより深くするための大きな一歩を踏み出す結果となりました。デオキシリボ核酸（DNA）は、4つの窒素、アデニン(A)、シトシン(C)、グアニン（G）とチミン（T）から成ります。これら４つのベースからなる一連のものは、細胞もしくは器官の特徴の制御を可能にするためのコードを構成します。
【染色体のマッピング】
ヒトゲノムはDNAから作られる24種類の染色体70億個で構成されます。これらの染色体は、体を構成する22個の染色体のペアと2つのX染色体（女性）もしくはX、Y（男性）1つずつのペアを持つ合計23ペアの染色体の組から構成されます。個々の染色体内では遺伝的活性が非活動領域において起こります。ヒューマンゲノム計画の目的の一つは活動領域と非活動領域の把握及びマッピングをすることです。活動領域は遺伝子とコーディング領域を持っています。そこでは一般的にどのタンパク質が作られるかを指定します。コーディング領域では、いつ、どの様にタンパク質が作られるかを決めます。
【問題の解決】
ヒューストン大学の Dr. Dan Davisonは、このような広範囲の周期性の確認を人間のβヘモグロビン遺伝子複合体で試験するのにDADiSPを用いました。目的の達成に向けた方法は実に単純で率直です。D N A 配列は最初(A=1、C=2、G=3、T=4)としました。βヘモグロビン複合体のデルタ遺伝子のグラフをウインドウ１に表示しています。上流や下流の無いコーディング領域がその時選ばれます。
ユーザー：ヒューストン大学
キーワード：生物学アプリケーション/DNAシーケンスの解析/染色体のマッピング